Recursos Computacionais

14/07/2020 Luis Ricardo Manrique

Conexão remota – VPN/NDF

O serviço de VPN fornece conectividade à rede do NDF a partir de qualquer computador conectado à Internet, possibilitando o acesso aos recursos computacionais (desktops ou workstations) e sites/periódicos que exigem um endereço IP da Universidade de São Paulo.

Para solicitar a criação de conta e mais informações sobre o acesso, envie um e-mail para renato.silva.guimaraes(arroba)alumni.usp.br com os seguintes dados: nome completo, orientador (se for o caso) e vínculo.

Workstations

O NDF possui recursos computacionais que são compartilhados e que podem ser acessados remotamente.
Segue abaixo uma breve descrição do hardware e software das máquinas:

Hostname Processador Número de Núcleos Memória Sistema Operacional
intel01.ndf.poli 2 x Xeon X5650 12 cores, 24 threads 48GB CentOS 8
intel02.ndf.poli 2 x Xeon X5650 12 cores, 24 threads 96GB CentOS 8
intel03.ndf.poli 1 x i7-3930K 6 cores, 12 threads 32GB CentOS 8
intel04.ndf.poli 1 x i7-3930K 6 cores, 12 threads 64GB CentOS 8
intel05.ndf.poli 2 x Xeon e5-2680 16 cores, 32 threads 48GB CentOS 8
intel06.ndf.poli 2 x Xeon e5-2620 16 cores, 32 threads 32GB CentOS 8
intel07.ndf.poli 1 x Xeon W-2255 10 cores, 20 threads 64GB CentOS 8
intel08.ndf.poli 1 x i9-10900K 10 cores, 20 threads 128GB Windows 10
intel09.ndf.poli 1x I7 10700 8 cores, 16threads 16GB Windows 10
intel10.ndf.poli 2x Intel Xeon Silver 4208 16 cores, 32 threads 1 TB CentOS 8
hydra01.ndf.poli 2x Intel Xeon E5-2620 12 cores/24 threads 94GB CentOS 9
hydra02.ndf.poli 2x Intel Xeon E5-2620 12 cores/24 threads 94GB Debian Bullseye
hydra03.ndf.poli 2x Intel Xeon E5-2620 12 cores/24 threads 110GB Ubuntu 20.04
hydra04.ndf.poli 2x Intel Xeon E5-2620 12 cores/24 threads 94GB CentOS 9

 

Para criar uma conta é necessário enviar um e-mail para renato.silva.guimaraes@alumni.usp.br utilizando o seu e-mail institucional. Os dados necessários são: nome completo; tipo de vínculo; orientador (se for o caso) e período de permanência (se for o caso).

Com a conta de acesso, é possível utilizar qualquer um dos computadores, porém, é necessário estar conectado à rede do NDF via VPN. Os computadores intel01-07 possuem o Sistema Operacional CentOS 8, que conta com interface gráfica e com os softwares GCC 8.3, python3, openmpi, OpenFOAM, Ansys, Firedrake, entre outros. A máquina intel08 conta com o Sistema Operacional Windows 10.

Os computadores com Linux possuem o diretório /share, ele é um link do storage de 6TB em comum para todas as máquinas e serve como uma área de transferência. Nesses computadores não há um sistema de filas, utilize comandos como o htop para identificar uma máquina com baixo uso no momento em que for rodar seus códigos.

Exemplo de acesso:
ssh -X user@intel01.ndf.poli

Cluster Mintrop

O cluster Mintrop é um recurso HPC local que tem como objetivo principal dar apoio ao projeto STMI, ele é composto por 18 nós com diferentes arquiteturas.

Especificações Técnicas

Qtd Tipo Processador Cores/nó Memória/nó Acelerador Uso
1 Intel 2 x Xeon Gold 6130 32 192GB —————- login e compilação de código
10 Intel 2 x Xeon Gold 6148 40 192GB —————- processamento
2 GPU 2 x Xeon Gold 6130 32 192GB 4 x NVIDIA Tesla V100 processamento
2 AMD 2 x AMD EPYC 7601 64 512GB —————- processamento
1 ARM 2 x Marvel ARM ThunderX2 64 512GB —————- processamento
1 FPGA 2 x Xeon Gold 6130 32 192GB 2 x Intel FPGA programação FPGA (Quartus) / X11
1 Visualização 2 x Xeon Silver 4110 16 96GB 1 x NVIDIA Quadro P4000 acesso X11 – software de visualização
1 Intel 2 x Xeon Gold 6240R 48 384GB —————- processamento

Canais de Suporte

Documentação atualizada

https://drive.google.com/drive/folders/18NrFs7pWk_PPx2S6NF1RwfqFz5nxuE5n (permissão de leitura somente para usuários autorizados)

Modelo de agradecimento pelo uso do Cluster Mintrop

The cluster Mintrop was acquired with resources of the infrastructure project  registered as ANP 20482-6, “Infrastructure to develop software technologies for modelling and inversion, with applications in seismic imaging”  (University of São Paulo / Shell Brasil / ANP) – “Infraestrutura para o desenvolvimento de técnicas numéricas e software para problemas de inversão com aplicações em processamento sísmico”, sponsored by Shell Brasil under the ANP R&D levy as “Compromisso de Investimentos com Pesquisa e Desenvolvimento”.

Tutoriais